在這個階段總會辦的神學會，最早開始時間在一九四五年的十一月一日，結束在一九四六年的一月一日。地點在四川。從具體情況看，與四川更密切一些。但按本書歷史階段時間的划分，以及其舉辦是以“總會”名義舉辦的。於是就不得不放在這里敘述。
這一次神學會，魏以撒在第十一次全大上的發言，曾明確提到，但未見詳細記載，只在《卅年專刊》找到了相關資料，比較簡略。謂：
“總會奉令內遷，到了四川之重慶以后，聖工漸漸展開，各地方就不斷有請人的消息。在李正誠、董玉林等極力提倡之下就開起神學的大工。
一， 定名：為真耶穌教會總會神學講習會。
二， 地點：在重慶總會所在地。
三， 日期：是民國三十四年（一九四五年）十一月一日起至一月一日止，共兩個月。
四， 教授：魏以撒理事長。
五， 功課：有講道學、牧會學、約櫃、道網要綱、啟示錄全書句解、本會組織法。
六，學員：共三十余人。每日四堂，晚會照常上課。但不禁外人參加。在這一次畢業的男女學員，大都能作美好的工人。或到南洋傳道，或在總會供職，在開發貴州本會，或在四川成立布道隊，或專任牧養，不怕艱苦……。”