北平的情況可以說是三起三落，總的情況不太好，雖說是真耶穌教會的發源地。在最初，總會多在外地工作、去外地發展真會，而對於本地，北平，反倒沒有下多大功夫，不能兼顧。據《卅年專刊》說，后來，被長子會搞垮了。一九二六年重建，又被孫彼得弄毀了，直到抗戰勝利以后才又有人重新籌建。
《卅年專刊》說，北平真耶穌教會被長子會弄倒了以后，在相當長的時間里都處於停止狀態;雖然也有人分地聚會，但并無一個掛牌的地方。
張巴拿巴發行之《聖靈報》，則於第五號（一九二五年十二月十六日出版）見證類中記北京情況曰：“北京本會，蒙神感動長沙之李亞媛女士，并朱沿賢女士，首先引領多人聚會。近復有由滬本會蒙恩之孫女士來此幫助。想有此三位女士同心協力，漸漸發展，必能興旺……。”
李亞媛等人事，又見於《卅年專刊》，內容則更詳細一些：謂“有一位生長在北京本會的負責人，為了北京沒有了本會非常焦急。就在民國十五年（公曆一九二六年），集合在協和醫院的李曉峰的女兒亞媛、朱尚賢和孫鏡媛、王小姐等提倡租房建立，事就這樣成了。先在西城錢糧胡同掛牌。北屋三間作會堂，南屋由孫李二小姐居住。主與那位負責的人同在，行了些非常的奇事，於是教會日漸興旺，不斷有受洗的人們。曾派時仁航長老前去牧養。”
而這時卻來了孫鏡媛的哥哥孫彼得永年，攪壞了北平真會。
孫永年彼得，《卅年專刊》說他原患邪魔病，西醫無效，進入真會才得了醫治。當時才二十多歲。一九二六年，作為北京代表，參加了總會第一次神學會、第四次全國代表大會，還編了一張報紙叫做《棄暗就光》，八開，五號字的小報。是在民國十五年（一九二六）十一月廿六日經南京真耶穌教會總本部檢閱，十二月一日，北京真耶穌教會印的。《卅年專刊》評曰：“其實還是經張（巴拿巴）一人檢閱”的，“內容完全以反對魏保羅為本會之發起人一節”。因受張殿舉之毒很深，常常給他妹妹孫鏡媛寫信，毀辱魏保羅父子。與時仁航長老也常常不和，甚至趕走他。
《卅年專刊》記孫彼得到北京以后，反張倒魏，獨樹一幟，印發“改造真耶穌教會大會宣言”，極盡誹謗之能事。除遼寧的唐東娥和李東霞贊成而外，無人理他，大會當然也沒開成。而這時，天津的戴大同和他聯合，在天津又掛起了真耶穌教會的招牌。但其目的是藉此好收復真會的“靈胞”，只是為宣傳而設的；這是他們自己承認的真話。
《卅年專刊》說是“邪靈又帶了七個比自己更惡的鬼充滿了孫彼得。使他自高自大，宣言自己就是真彼得再世。教權獨握、凶狠怒罵、大行審判。因為沒有人有辨別得諸靈的恩賜，就是有，他也不能聽的。甚至給已經在本會受了洗的人重新受他的洗。他發生了極大的錯誤的心，倒行逆施，大大得罪救過他的主，踐踏主耶穌的寶血。不久也就死去了。在他沒有死的時候，聽說他偷用了李亞媛的錢——或者也有別人捐的——在東城買了一座房產。於是就改名叫了‘新耶路撒冷聖城會’。聽說李亞媛瘋死就是為那筆錢受了大的刺激所致。”孫永年死於一九三零年，臨死之前改的“新耶路撒冷聖城會”，總共迷惑了約百余人。天津戴大同也把他利用的真會牌匾換成了“新耶路撒冷聖城會”。
孫永年一事，據張巴拿巴之子張石頭撰《真耶穌教會歷史》一書，孫永年彼得，又名孫提多，曾與福建、南洋的一些人聯合行動，請參閱福建部分。
在這個階段中，張巴拿巴曾經到過北京。《傳道記》載民國十六年（公曆一九二七年）七月，張巴拿巴在“上海本會……厥后疊接北京來函。於是我於七月偕孫竹林執事同往北京。開會七天，遍貼廣告。於是來求真道者甚多。北京老會大為震驚，每日和我戰爭，皆不能取勝。由是聖靈大降，本會大大興旺了。受靈洗者，日日加多。”
從以上記載看，魏以撒在乃父創教的發源地，已完全喪失了影響。不過張巴拿巴所說“本會大大興旺了”也值得懷疑，因為從此以后，找不到資料可資佐證。《卅年專刊》說是直到抗戰勝利以后，才又有人開始籌划。